西医西药对非淋菌性尿道炎的初发阶段及未出现耐药菌株的情况下的治疗还是有一定疗效的，但随着耐药菌株的出现，及对于部分尿道炎症状持续不退，或并发前列腺炎，附睾炎，宫颈炎等合并症的患者，疗效则不甚满意。
一些不负责任的医院采用增加药量及很多种西药联合使用，超时限用药，毒副作用太大，肝脏、肾脏的负担过大，使肝、肾功能下降，人体免疫力也随之下降，人体免疫力下降又使病情加重或有并发感染，形成恶性循环，久治不愈，或越治越重。
反复大量使用广谱抗生素导致体内菌群失调，免疫力下降，使原本不致病的病原体，真菌，微生物大量繁殖，成为诱发新的感染或加重原有感染的根源。如非淋患者大量使用抗生素后诱发霉菌性阴道炎或霉菌性龟头炎!
非淋并非不治之症，关键是要选择正规的医院，以求早诊断早治疗。不要一听说非淋就害怕，担心被别人认为自己生活不检点，就向家人隐瞒，使家人在不知情的情况下被传染，这样不仅仅是对家人不负责任，而且也不利于自己的康复。要知道非淋是可以治愈的疾病，关键在于科学地认识与正确地对待。
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